甲型H1N1流感病毒（Swine influenza virus，SIV）是猪群中一种可引起地方性流行性感冒的正黏液病毒（Orthomyxoviruses）。现在在墨西哥爆发的甲型H1N1流感是由A型流感病毒引起的猪呼吸道传染病，初步研究检测出这种病毒是Ａ型流感病毒，携带有Ｈ1Ｎ1亚型甲型H1N1流感病毒毒株，包含有禽流感、甲型H1N1流感和人流感三种流感病毒的脱氧核糖核酸基因片断，同时拥有亚洲甲型H1N1流感和非洲甲型H1N1流感病毒特征。　　世界卫生组织称，这次引发甲型H1N1流感的病毒是禽流感和人类流感经过“洗牌效应”产生的新病毒。不同的病毒相遇后交换基因，变异为新型的混种病毒，因此人类对其缺乏免疫力。这将使得此次甲型H1N1流感疫情的波及范围和后续影响难以估测。但该病毒的攻击性，人体免疫力的个体差异和人类从对抗各种流行性感冒中所获取的综合抵抗力都是决定这次疫情状况的最重要因素。